2月17日，明沿海总兵：陈洪范，在夺回石城岛后，又继续追击叛贼：沈志祥，去到黄骨岛上，面对走投无路的情况下，叛贼：沈志祥，也学满清三顺王的做法，也派遣部将：吴朝佐、金光裕，前往满清盛京城上疏请降。

此时满清太宗：爱新觉罗·皇太极，正在漠南蒙古打猎，还宴请诸王贝勒们共进晚家宴，仅有满清安平贝勒：爱新觉罗·杜度，前来招待使者还让使者转告让其放弃黄骨岛，前去安山城。

随后自己便带领部下去沙河堡接应。

等满清安平贝勒赶到后，由沈志祥带头归降，麾下有部将；左右参将9人、游击将军18人、都司31人、守备30人、千总40人、诸生2人，共计军民2千5百人。

2月23日，满清太宗亲征骚扰归化城的漠北蒙古喀尔喀札萨克图汗：孛儿只斤·素巴第，途中经过万全都指挥使司时，就向大明边臣致书要求「讲和开市」，毕竟关外小冰期粮食紧缺。

但是明宣大总督：卢象升，一眼就看出来了满清这是借着开市名义补充物资，好继续攻打大明，因此予以拒绝，还强调道“他夷可抚，东虏建奴断不可轻抚。”

并对满清八旗严阵以待，还以重炮击退满清使者…。

待满清太宗回国都后，就有人上报此事，对此满清太宗极为重视，毕竟此人可是大明海上的官二代若是归降大清，那么对于日后招揽明将大有帮助。

因此第一时间就命令满清内国史院笔帖式：胡球、满清户部承政：纳拉·马福塔，等官员先犒劳明降将：沈志祥，为他接风洗尘并选出铁岭卫、抚顺守御千户所，两处给他当做屯军之地。

最后沈志祥选择了抚顺守御千户所作为屯军所，还被满清太宗赐封为〈续顺公〉。

3月26日，明沿海总兵：陈洪范，继续来往于石城岛，一面处理明叛将：沈志祥，之乱的善后事宜，一面又屡次派人联络李氏朝鲜王国继续抗清，以及恢复海岛之事。

但李氏朝鲜仁祖陵阳大君纯孝郡王：李倧，却迫于满清的压力，所以并没有接受明沿海总兵送来的文书，也没有回复！

不过这倒是让李氏朝鲜义州府府尹：林庆业，非常担心会引起满清方面的察觉？便派人哭着劝说陈总兵的使者，近期就不要再来李氏朝鲜王国了，以免引起不必要的麻烦。

4月10日，明兵部尚书：杨嗣昌，以明叛将：沈志祥，降清为契机特此下令将东江镇所辖诸岛剩余数千名军民，尽数撤到辽东都指挥使司地区不得有误。

4月18日，明宣大总督：卢象升，之父明南直隶宜兴县知县：卢国霦，在山西行都指挥使司阳和卫探望完儿子卢总督后，便在返乡途中不幸去世！

同时朝中的明兵部尚书借着皇帝陛下之名义，私下传旨给明山海卫监军：高起潜，让派了一个算命瞎子：周元忠，带着六个侍卫前往大清国都盛京城内打探消息，顺便提下议和之事。

5月11日，明宣大总督得知父亲去世的消息后，痛不欲生，连忙上疏朝廷乞求回乡奔丧，但是他的职位特殊且负责防御漠南蒙古诸部以及满清军队，因此明毅宗信王崇祯帝：朱由检，不准轻易离职，只是让他以席丧代替。

因此卢总督只得身披麻衣、脚穿草履、头裹白巾，还连上七次奏折请求回乡，无奈之下明毅宗也不是不讲情义之人，便派明山海卫监军：高起潜，为［宣大监军］，并让明宣府总镇巡抚：陈新甲，为新任〈宣大总督〉。

这才让卢象升得以穿着丧服交接回乡奔丧。

而朝中的明兵部尚书还推荐明宣大总督：陈新甲，给明毅宗让其加封为「兵部右侍郎兼都察院右佥都御史」，就因此人也是个主和派。

5月24日，明刑部尚书：刘之凤，奏陈道“天下囚徒皆五年一审录，而高墙内宗室罪犯，长期不予审讯，请对高墙罪同于天下四徒例。”

对此明毅宗给予批准，还规定高墙罪宗室五年一审例，还下令京师军民殊死以下特许保候即结。

6月初2日，在北直隶帝都顺天府内城西直门内的安民厂火药局发生重大事件，随着一声轰雷响起，方圆十余里内，地轴摇撼不已如地震一般，宫殿屋瓦均被震碎，梁尘飞扬西北隅白云滃郁，弥漫亘空，中夹苍黄黑子，旋转云际。

许久烟雾才散去，周边的树木均枯萎，街边行人或死或伤，死皆焦黑如炭，明安民厂太监：王甫、明广平库使：张之秀，当场俱毙！

事后据查居民死伤万余人，武库几乎空荡，朝廷只得发五千金赈恤。

8月15日，因外戚明英国公：张春，等数家诳财虐民，每征子钱，夺人田宅子女，惹得官员上奏刑部用刑。

气得明毅宗立即出面口谕外戚明博平伯：郭振明，等人说道“皇戚驸马之家，姻联帝室，禄享天糈，回视闾阎，不啻天渊，仁人君子，当此遭际，必安心守分，不负国恩，厚德养俭，以保身名。乃有蔑弃礼法，或滥交（岂页）权，至纵令恶棍鱼肉