｛中军｝分别对尼德兰船队的军力进行部署。

其中明延平卫游击将军兼前锋：郑芝龙，自行出资购买斯图亚特王国（英国）火炮加装于明军船只，而尼德兰船队再次前往漳州府（漳州卫）河岸停泊。

9月18日，海盗派出6艘船只与尼德兰船队会合。

9月19日，尼德兰船队再次前往川陵山海域停泊。

9月22日，在朝堂之上明毅宗信王崇祯帝：朱由检，得知荷兰红毛夷在大明福建承宣布政使司沿海烧杀抢掠，对此十分不满，他立即下令升明都察院福建道监察御史：路振飞，为〔福建总镇巡按〕负责查办。

同时明福建总镇巡抚：邹维琏，也接到了朝廷圣旨要严令惩荷，因此明福建总镇巡抚便飞谕各地文武将吏，不许再谈［互市］二字，要誓以一身拼死挡夷。

10月初2日，尼德兰王国荷属东印度公司驻台湾府总督又派出weesp号、tessel号前往暹罗国（阿瑜陀耶王朝），而大明海盗：刘香，则率领船队12艘帆船抵达尼德兰船队处。

10月初7日，尼德兰船队caijck号、boucaspel号，因风暴搁浅损毁。

10月初8日，在古雷巡检司吉钓湾，明军见有夷船一艘靠近岸边，便带领冲锋兵三十余人喊杀，吓得红毛夷众慌忙乱跳水，被我军斩杀者无数，俘获三十余人，斩级十余颗。

10月10日，尼德兰船队受到明军战船的攻击，海盗船马上前来支援，并向尼德兰王国荷属东印度公司驻台湾府总督：汉斯·普特曼斯，邀功。

10月12日，明福建总镇巡抚：邹维琏，从福建布政司衙门到达漳州府（漳州卫），当即就檄榜调集诸将并抽调水师，依旧由明延平卫游击将军：郑芝龙，为先锋、明福州府南路副总兵：高应岳，为左翼、明泉南游击将军：张永产，为右翼、明澎湖巡检使：王尚忠，为游击将军。

只是以明福建布政使司左参议：吴震元、明漳州卫经历使：陈梦珠，两人为〈记功散赏〉，待一切安排妥当后，就散发海战方略给诸将。

10月13日，8艘海盗船只与尼德兰船队汇合。

同时由于当初明广鹿岛左参将：尚可喜，曾参与镇压皮岛兵变，使得这位新任的明东江总镇总兵：沈世魁，之前失去了权力，所以沈总镇总兵对他怀恨在心，正伺机报复。

恰巧明东江总镇水营左参将：王庭瑞、明皮岛游击将军：袁安邦，等部将献计调尚参将前来，打算诬以罪名。

于是沈总镇总兵就召明广鹿岛左参将前来到皮岛，可他们刚到达大长山岛就遇上了大风，船只前进不得，恰在这时沈总镇总兵又发一封檄榜催促尽快回去商议军情。

这不免让明广鹿岛左参将感觉不妙，他发现其手下诸营将领都有熟人带信来迎，唯独与自己一向交好者无一语至，再加上风大浪急，不免心疑，遂派人到皮岛打探消息。

很快部下明广鹿岛千总：许尔显，连忙跑来汇报情况，当他得知沈总镇总兵的阴谋时，尚参将不在打算启程，而是计谋下一步去向？

在一番权衡利弊之后，尚参将决定效仿孔、耿二人去投降自己的杀父仇人，但是又不知后金汗国方面是何想法，毕竟自己官低言微，在大明这肯定没人保他性命，去后金也得先了解一下情况。

随即便派遣明广鹿岛千总：许尔显、明大长山岛千总：班志富，等诸部下前往后金汗庭盛京城与后金天聪汗：爱新觉罗·皇太极，见面洽谈。

这让后金天聪汗得知又有明将来投，大呼“女真语：真乃天助本汗也。”

随即就赐尚可喜部军队名为［天助兵］还派人前去接应，而尚可喜自从派出使者后，自己害怕被明军追击，便也北逃进入后金防区～金州中左守御千户所境内避难。

10月15日，明福建总镇巡抚亲自到海澄县指挥明军船队并且誓师督战。

10月17日，明军得知尼德兰船队以及大明海盗船队的位置与规模（夹版船9艘，海盗50多艘），便下令福建都指挥使司所有明军水师出击。

10月18日，明军在铜山守御千户所外海以8艘战船、2艘火船，去拦截2艘尼德兰船只。

10月19日，明军主力部队集结完成。

直到10月22日，在金门守御千户所料罗湾海域，最终爆发了大明、尼德兰水师大战。

尼德兰船队以8艘帆船和海盗50艘大小的帆船，与福建明军水师50艘大型战船、100艘火船对抗。